Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Hoxb1P17919 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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