Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Vpreb2P13373 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC8.09□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms