Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Vpreb1P13372 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms