Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
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Cxcl2P10889 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cxcl2P10889 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms