Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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PtprqP0C5E4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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PtprqP0C5E4 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
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PtprqP0C5E4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
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PtprqP0C5E4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
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PtprqP0C5E4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PtprqP0C5E4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
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PtprqP0C5E4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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PtprqP0C5E4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprqP0C5E4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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PtprqP0C5E4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprqP0C5E4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
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PtprqP0C5E4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprqP0C5E4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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PtprqP0C5E4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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PtprqP0C5E4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprqP0C5E4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PtprqP0C5E4 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
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