Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01800 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01800 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01800 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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