Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ldb2O55203 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ldb2O55203 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ldb2O55203 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ldb2O55203 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ldb2O55203 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ldb2O55203 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ldb2O55203 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ldb2O55203 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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