Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Copb2O55029 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Copb2O55029 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Copb2O55029 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Copb2O55029 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Copb2O55029 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Copb2O55029 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Copb2O55029 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Copb2O55029 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Copb2O55029 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Copb2O55029 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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