Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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DffaO54786 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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DffaO54786 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DffaO54786 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
DffaO54786 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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