Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rab33bO35963 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms