Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timm44O35857 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Timm44O35857 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms