Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Clk2O35491 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms