Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smad6O35182 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms