Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Casq1O09165 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Casq1O09165 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Casq1O09165 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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