Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms