Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Efna3O08545 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Efna3O08545 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms