Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2056J3QQ02 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms