Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Alkal1J3QPP8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkal1J3QPP8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkal1J3QPP8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkal1J3QPP8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkal1J3QPP8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkal1J3QPP8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkal1J3QPP8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkal1J3QPP8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkal1J3QPP8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkal1J3QPP8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkal1J3QPP8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkal1J3QPP8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Alkal1J3QPP8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms