Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5849J3QPE5 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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