Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r167G3UW71 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r167G3UW71 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r167G3UW71 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vmn1r167G3UW71 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r167G3UW71 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r167G3UW71 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r167G3UW71 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r167G3UW71 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r167G3UW71 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r167G3UW71 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r167G3UW71 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r167G3UW71 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vmn1r167G3UW71 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Vmn1r167G3UW71 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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