Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm8247F6VRJ8 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms