Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SafbD3YXK2 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms