Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Nipsnap3aB1AWZ3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms