Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Prkag2-201ENSMUST00000030784 3331 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm43457-201ENSMUST00000200867 2409 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Tmem238A9JSM3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms