Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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H2-M5A7VMS3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M5A7VMS3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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