Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnf39A2RT81 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnf39A2RT81 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf39A2RT81 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf39A2RT81 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf39A2RT81 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf39A2RT81 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf39A2RT81 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf39A2RT81 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf39A2RT81 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf39A2RT81 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf39A2RT81 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms