Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtf1A2AQ19 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rtf1A2AQ19 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtf1A2AQ19 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rtf1A2AQ19 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rtf1A2AQ19 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rtf1A2AQ19 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtf1A2AQ19 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms