Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syndig1A2ANU3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms