Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubl3Q9Z2M6 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms