Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R3

Apom, Apolipoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApomQ9Z1R3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
ApomQ9Z1R3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApomQ9Z1R3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApomQ9Z1R3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApomQ9Z1R3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApomQ9Z1R3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApomQ9Z1R3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
ApomQ9Z1R3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms