Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ChmQ9QXG2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms