Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms