Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Col5a3Q9JLI2 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms