Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmod4Q9JLH8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmod4Q9JLH8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms