Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms