Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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Rb1cc1Q9ESK9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Rb1cc1Q9ESK9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Rb1cc1Q9ESK9 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Rb1cc1Q9ESK9 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rb1cc1Q9ESK9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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