Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tlr1Q9EPQ1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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