Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms