Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms