Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hmg20aQ9DC33 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hmg20aQ9DC33 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms