Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrn2Q9DBR1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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