Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Derl3Q9D8K3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Derl3Q9D8K3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms