Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmigd1Q9D7L8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmigd1Q9D7L8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms