Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdr42e1Q9D665 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms