Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms