Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ssbp3Q9D032 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms