Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Sgo1Q9CXH7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Sgo1Q9CXH7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Sgo1Q9CXH7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Sgo1Q9CXH7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Sgo1Q9CXH7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Sgo1Q9CXH7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Sgo1Q9CXH7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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