Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ctnnbl1Q9CWL8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctnnbl1Q9CWL8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctnnbl1Q9CWL8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctnnbl1Q9CWL8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctnnbl1Q9CWL8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctnnbl1Q9CWL8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctnnbl1Q9CWL8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ctnnbl1Q9CWL8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ctnnbl1Q9CWL8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ctnnbl1Q9CWL8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ctnnbl1Q9CWL8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ctnnbl1Q9CWL8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ctnnbl1Q9CWL8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbl1Q9CWL8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms