Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Nicn1Q9CQM0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms