Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Chmp3Q9CQ10 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms